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Bioinformática Básica - 2º Oferta

Unidade/ofertante: Fiocruz Mato Grosso do Sul Telefone: Tel: (67) 3346-7220
C Capacitação/Cursos Livres
Presencial
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Sobre o curso

Este curso de Bioinformática Básica, utilizando a Plataforma Galaxy, vem atender a uma demanda dos serviços de saúde e Instituições de Ensino Superior (IES) em relação à análise de sequenciais genômicas, com a utilização de ferramentas de Bioinformática. Trata-se de um curso introdutório, em que serão apresentados os conceitos básicos da Bioinformática, não estando previsto um detalhamento dos temas abordados. Será ofertado na modalidade presencial, em Campo Grande/MS

Este curso vem atender a uma demanda dos serviços de saúde e Instituições de Ensino Superior (IES) em relação à análise de sequenciais genômicas, com a utilização de ferramentas de Bioinformática. Serão apresentados os conceitos básicos da Bioinformática, não estando previsto um detalhamento dos temas abordados. Ofertado na modalidade presencial, tem como pré-requisito para certificação 100% de presença do cursista.  
Organização: 
Fiocruz Mato Grosso do Sul.

Apoio:
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul.
Universidade Católica Dom Bosco. Ementa:
Histórico da ferramenta Stingray; Introdução aos conceitos de pipeline e workflow; Introdução à ferramenta Galaxy; Stingray@Galaxy; Como acessar o ambiente (interface e suas separações, ferramentas com suas localizações); Desenho do Workflow; Execução do Workflow; Aquisição de dados. Administração do History; Uso pelos laboratórios; Criação de grupos, regras (roles) do laboratório (admin e users); Criação dos usuários; Permissões; Quota por usuário; Genoma: conceitos e datasets; Inserção dos dados NGS e pré-processamento; Execução de um preditor de genes (Glimmer3); Execução do BLAST/DIAMOND; Utilização do Artemis para anotação (geração de arquivos Artemis, visualização); Utilização do Prodigal (Microbial Gene Prediction).

Objetivos:

  • Atualizar os estudantes e profissionais de saúde na área da Bioinformática.
  • Apresentar os conceitos iniciais de análise de sequencias genômicas, usando diferentes ferramentas de bioinformática.


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