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Identifying Gene Regulatory Networks from Gene Expression Data - 1º Oferta

Unidade/ofertante: Instituto René Rachou Telefone: (31) 3349-7700
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Sobre o curso

As redes de regulação gênica (GRN) são fundamentais para o controle genômico do desenvolvimento em animais e plantas. O estudo de GRNs requer insights de vários campos de pesquisa, incluindo biologia de sistemas, biologia evolutiva e desenvolvimento, bem como genômica funcional, e fornece uma abordagem integrativa para questões fundamentais de pesquisa em biologia. Desta forma, o curso foi organizado em duas partes, permitindo uma ampla compreensão sobre as GRNs. A primeira parte do curso enfatizará a teoria de redes complexas (grafos) e técnicas de construção dessas redes, bem como suas aplicações na resolução de problemas em áreas amplas como Matemática, Saúde Coletiva e Biologia. Serão utilizadas diferentes visualizações e análises de redes e plataformas, linguagens de programação e algoritmos de construção de redes, incluindo, mas não restritas a: Gephi e Cytoscape, Python, bibliotecas NetworkX e R iGraph. Na segunda parte, serão introduzidos os conceitos básicos de GRN e apresentados os métodos experimentais e computacionais atuais utilizados para estudá-las. O curso abrangerá uma ampla gama de tópicos de GRNs e, ao final do curso, espera-se que os alunos saibam como gerar modelos GRN baseados em dados extraídos da literatura, bem como modelos computacionais para analisar o comportamento do circuito dinâmico.

Uma Rede de Regulação Gênica (ou GRN, do inglês Gene Regulatory Network) é uma coleção de reguladores moleculares que interagem uns com os outros e com outras substâncias na célula para regular os níveis de expressão gênica de mRNA e proteínas. Elas desempenham um papel central na morfogênese - a criação de estruturas do corpo - o que as torna fundamentais para o controle genômico do desenvolvimento em animais e plantas.

Essas interações regulatórias entre genes podem ser estudadas em grande escala, permitindo, por exemplo, entender as cascatas de regulação gênica, ou elucidar a conexão entre regulação gênica e fenótipo. Dessa forma, o estudo de GRNs requer contribuições de vários campos de pesquisa, incluindo Biologia de Sistemas, Biologia Evolutiva do Desenvolvimento e Genômica Funcional, e fornece uma abordagem integrativa para questões fundamentais de pesquisa em Biologia.


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