Ementa
Objetivo Geral
O objetivo do curso e capacitar alunos em analises de genomas bacterianos para caracterizar a multirresistente aos antimicrobianos , | determinar a presença de elementos moveis envolvidos na disseminação de genes de resistência e estabelecer possíveis relações
filogenéticas entre linhagens analisadas.
Objetivos Educacionais/Aprendizagem
Espera-se que ao final do curso o aluno esteja habilitado a analisar genomas bacterianos com a finalidade de determinar o mobilamo e regiões genômicas envolvidas com a resistência aos antimicrobianos, bem como desenvolver senso critico em relação as abordagens realizadas durante o curso.
Metodologia
Os genomas de C . striatum de infecções nosocomiais e os obtidos do banco de dados GenBank serão utilizados para definir o core e o pan genoma utilizando o pipeline GET_ HOMOLOGUES. Os genomas serão submetidos aos bancos de dados ResFinder e Arg-annot para pesquisa de genes associados a resistência . O mobilamo sera determinado utilizando o software GIPSY para identificar ilhas
genômicas de resistência e os bancos de dados PlasmidFinder e ISFinder para busca de plasmídeos e sequencias de inserção.
Avaliação
A avaliação sera realizada com a apresentação de relatório e de resultados das analises genômicas realizadas durante o curso livre .
Pre-requisitos Mestrado concluído
O objetivo do curso e capacitar alunos em analises de genomas bacterianos para caracterizar a multirresistente aos antimicrobianos , | determinar a presença de elementos moveis envolvidos na disseminação de genes de resistência e estabelecer possíveis relações
filogenéticas entre linhagens analisadas.
Objetivos Educacionais/Aprendizagem
Espera-se que ao final do curso o aluno esteja habilitado a analisar genomas bacterianos com a finalidade de determinar o mobilamo e regiões genômicas envolvidas com a resistência aos antimicrobianos, bem como desenvolver senso critico em relação as abordagens realizadas durante o curso.
Metodologia
Os genomas de C . striatum de infecções nosocomiais e os obtidos do banco de dados GenBank serão utilizados para definir o core e o pan genoma utilizando o pipeline GET_ HOMOLOGUES. Os genomas serão submetidos aos bancos de dados ResFinder e Arg-annot para pesquisa de genes associados a resistência . O mobilamo sera determinado utilizando o software GIPSY para identificar ilhas
genômicas de resistência e os bancos de dados PlasmidFinder e ISFinder para busca de plasmídeos e sequencias de inserção.
Avaliação
A avaliação sera realizada com a apresentação de relatório e de resultados das analises genômicas realizadas durante o curso livre .
Pre-requisitos Mestrado concluído