Justificativa
A análise de dados de RNA-Seq tornou-se uma ferramenta essencial na pesquisa genômica e transcriptômica, permitindo a compreensão de padrões de expressão gênica em diversos contextos biológicos, como saúde, biotecnologia, agronegócio e meio ambiente. Apesar do avanço das tecnologias de sequenciamento, muitos profissionais da área de genômica ainda enfrentam desafios nas etapas de processamento, análise e interpretação dos dados transcriptômicos.

O CLC Genomics Workbench oferece uma plataforma acessível, robusta e com interface amigável, facilitando a realização de análises de RNA-Seq, desde o controle de qualidade até a interpretação biológica dos resultados. A oferta deste curso é fundamental para suprir a demanda crescente por capacitação prática, permitindo que profissionais da área de genômica desenvolvam autonomia na condução de análises transcriptômicas, com o suporte de ferramentas modernas, eficientes e amplamente utilizadas em pesquisa e desenvolvimento.

Objetivo Geral
Capacitar profissionais, pesquisadores e estudantes da área de genômica na utilização do CLC Genomics Workbench para realizar análises de dados de RNA-Seq, abrangendo desde o processamento dos dados brutos até a análise de expressão gênica e interpretação funcional, por meio de atividades práticas, tutoriais guiados e consultoria especializada.

Objetivos Educacionais/Aprendizagem
Ao final do curso, os participantes serão capazes de:

• Identificar e compreender as etapas fundamentais da análise de dados de RNA-Seq, desde o controle de qualidade até a interpretação dos resultados biológicos.
• Navegar com autonomia no ambiente do CLC Genomics Workbench, utilizando seus principais módulos e ferramentas para análise de transcriptoma.
• Executar pipelines completos de análise de RNA-Seq, incluindo importação de dados, controle de qualidade, alinhamento, quantificação e análise de expressão gênica diferencial.
• Interpretar e visualizar resultados de análises de expressão gênica, aplicando métodos de anotação funcional e análise biológica.
• Aplicar boas práticas em bioinformática para organização, análise, documentação e reprodutibilidade de projetos transcriptômicos.
• Reconhecer e solucionar problemas práticos comuns nas etapas de processamento e análise de dados de RNA-Seq.

Metodologia
O curso será ofertado em formato híbrido, com um dia de atividades remotas e um dia presencial. A abordagem metodológica combina exposições guiadas, tutoriais em vídeo, práticas supervisionadas e consultoria especializada, proporcionando uma experiência de aprendizagem ativa, aplicada e interativa.
No primeiro dia (remoto), os participantes terão acesso a tutoriais em vídeo e materiais introdutórios sobre o CLC Genomics Workbench, com atividades hands-on autoinstrutivas para familiarização com a interface e os fluxos de trabalho básicos.
No segundo dia (presencial), as atividades serão focadas em exercícios práticos com acompanhamento de especialista da QIAGEN, incluindo:
Análise de dados de RNAseq
Sessão de consultoria para discussão de problemas reais trazidos pelos participantes e orientação para aplicação do CLC em seus projetos.
A metodologia privilegia a aprendizagem baseada em problemas e na prática, com ênfase na autonomia do participante e no desenvolvimento de competências aplicáveis ao seu contexto de pesquisa ou trabalho.

Avaliação

A avaliação dos participantes será baseada na presença nas atividades (remota e presencial) e na interação durante as aulas e atividades práticas. Para a obtenção do certificado, será exigida a participação ativa nas sessões.

Pré-requisito
Cada participante deverá trazer seu próprio computador/laptop com as seguintes configurações mínimas recomendadas para uso do software CLC Genomics:

Sistema operacional (64 bits):

• Windows: Windows 10, Windows 11, Windows Server 2016, 2019 ou 2022

• Mac: macOS 13, 14 ou 15

• Linux: RHEL 8+, SUSE Linux Enterprise Server 12.5+ (outros sistemas Linux recentes podem funcionar, mas não são garantidos).

  • Para uso de funcionalidades BLAST, é necessário ter a biblioteca libnsl.so.1

Memória RAM:

• Mínimo: 8 GB

• Recomendado: 16 GB

Tela:

• Resolução mínima: 1024 x 768
• Recomendado: 1600 x 1200

Estrutura
Módulo 1 – Introdução ao CLC Genomics (Remoto)
Atividades autoinstrutivas com tutoriais em vídeo
Apresentação do software CLC Genomics Workbench: interface, ferramentas e fluxos de trabalho

Módulo 2 – Análises Práticas com CLC Genomics (Presencial)
Atividades práticas com acompanhamento de especialista da QIAGEN
Análise de dados de RNAseq
Geração de relatórios e exportação de resultados
Sessão de consultoria prática: aplicação do CLC Genomics a dados reais dos participantes