Apresentação

Este curso oferece uma formação prática e aplicada no uso do CLC Genomics Workbench (CLC Gx) para análise de dados de RNA-Seq, desde o processamento dos dados brutos até a interpretação dos resultados biológicos. O treinamento é dividido em dois dias: o primeiro dia será remoto, com atividades autoinstrutivas guiadas por tutoriais em vídeo, e o segundo dia será presencial (campus Fiocruz Maré - Rio de Janeiro/RJ), com acompanhamento de especialista da QIAGEN.

O cronograma inclui:
  • Atividades hands-on guiadas por tutoriais em vídeo;
  • Sessões práticas no CLC Genomics Workbench com especialista da QIAGEN;
  • Consultoria para resolução de dúvidas e orientação sobre dados e projetos dos participantes;
  • Atividades práticas de análise completa de dados de RNA-Seq, incluindo controle de qualidade, mapeamento, quantificação, análise de expressão diferencial e interpretação funcional.

Indicado para profissionais, pesquisadores, técnicos e estudantes que atuam na área de genômica e transcriptômica, o curso busca capacitar os participantes no uso da plataforma CLC Gx para análises de RNA-Seq, combinando teoria, prática e suporte especializado.

Total de Vagas: 20 vagas

Modalidade: Semipresencial

Carga Horária: 18 horas 

Detalhamento da carga horária:
  • Dia 1 (remoto): 09h00 às 16h30
  • Dia 2 (presencial): 09h00 às 16h30

Público Alvo:
Pesquisadores, profissionais, técnicos e estudantes de pós-graduação que atuam na área de genômica, transcriptômica, bioinformática ou ciências ômicas, interessados em adquirir competências práticas na análise de dados de RNA-Seq. O curso é especialmente voltado para aqueles que trabalham com dados de sequenciamento de nova geração (NGS) e desejam aplicar análises de expressão gênica utilizando o CLC Genomics Workbench.

Processo Seletivo:
As inscrições serão avaliadas pela Coordenação do Curso com base no interesse dos participantes e critérios do público-alvo levando em conta as respostas ao formulário de inscrição que deverão ser obrigatoriamente preenchidas:
  • Uso anterior do programa CLC Genomics (sim ou não).
  • Qual instituto e laboratório está vinculado.
  • Qual o vínculo institucional (Servidor, Terceirizado, Pós-doc, Mestrando, Doutorando, Outro - Especificar).
  • Justificativa do interesse em realizar este treinamento.
Pré-requisito:
Cada participante deverá trazer seu próprio computador/laptop com as seguintes configurações mínimas recomendadas para uso do software CLC Genomics:
Sistema operacional (64 bits):
  • Windows: Windows 10, Windows 11, Windows Server 2016, 2019 ou 2022
  • Mac: macOS 13, 14 ou 15
  • Linux: RHEL 8+, SUSE Linux Enterprise Server 12.5+ (outros sistemas Linux recentes podem funcionar, mas não são garantidos).
    • Para uso de funcionalidades BLAST, é necessário ter a biblioteca libnsl.so.1
Memória RAM:
  • Mínimo: 8 GB
  • Recomendado: 16 GB
Tela:
  • Resolução mínima: 1024 x 768
  • Recomendado: 1600 x 1200

Local de Realização do Curso:
Sala 1-101 do Pavilhão Luiz Fernando Ferreira (CPIV) - Fiocruz Campus Maré
Ambiente Virtual de Aprendizagem (AVA) - Campus Virtual Fiocruz