Dados do Curso
Justificativa
Com o avanço das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS), a análise de dados metagenômicos tornou-se essencial para estudos de microbiomas, saúde humana, ambiental, agrícola e industrial. No entanto, muitos profissionais enfrentam dificuldades na etapa de processamento e interpretação dos dados, seja por falta de ferramentas acessíveis ou por barreiras técnicas. O CLC Genomics oferece uma solução robusta e amigável para análise de metagenômica shotgun, genes marcadores (como 16S rRNA) e metatranscriptoma, sendo amplamente adotado em instituições de pesquisa e diagnóstico.
Este curso supre uma demanda crescente por capacitação prática no uso dessa ferramenta, oferecendo uma oportunidade única de aprendizado com tutoriais guiados, acompanhamento de especialistas e consultoria aplicada à realidade dos participantes. A formação contribui para a autonomia dos profissionais da área de genômica no uso de ferramentas modernas e para a melhoria da qualidade das análises bioinformáticas em projetos científicos e tecnológicos.
Objetivo Geral
Capacitar profissionais, pesquisadores e estudantes da área de genômica para realizar análises de dados metagenômicos (shotgun, metatranscriptoma e genes marcadores como 16S rRNA) utilizando o software CLC Genomics, por meio de atividades práticas guiadas, tutoriais e consultoria especializada, promovendo a autonomia no uso da ferramenta e a aplicação de boas práticas em bioinformática.
Objetivos Educacionais/Aprendizagem
Ao final do curso, os participantes serão capazes de:
Metodologia
O curso será ofertado em formato híbrido, com um dia de atividades remotas e um dia presencial. A abordagem metodológica combina exposições guiadas, tutoriais em vídeo, práticas supervisionadas e consultoria especializada, proporcionando uma experiência de aprendizagem ativa, aplicada e interativa.
No primeiro dia (remoto), os participantes terão acesso a tutoriais em vídeo e materiais introdutórios sobre o CLC Genomics Workbench, com atividades hands-on autoinstrutivas para familiarização com a interface e os fluxos de trabalho básicos.
No segundo dia (presencial), as atividades serão focadas em exercícios práticos com acompanhamento de especialista da QIAGEN, incluindo:
Análise de dados de genes marcadores (16S rRNA);
Análise de dados de metagenômica shotgun e metatranscriptoma;
Sessão de consultoria para discussão de problemas reais trazidos pelos participantes e orientação para aplicação do CLC em seus projetos.
A metodologia privilegia a aprendizagem baseada em problemas e na prática, com ênfase na autonomia do participante e no desenvolvimento de competências aplicáveis ao seu contexto de pesquisa ou trabalho.
Avaliação
A avaliação dos participantes será baseada na presença nas atividades (remota e presencial) e na interação durante as aulas e atividades práticas. Para a obtenção do certificado, será exigida a participação ativa nas sessões.
Pré-requisito
Cada participante deverá trazer seu próprio computador/laptop com as seguintes configurações mínimas recomendadas para uso do software CLC Genomics:
Sistema operacional (64 bits):
Memória RAM:
Tela:
Estrutura
Módulo 1 – Introdução ao CLC Genomics (Remoto)
Atividades autoinstrutivas com tutoriais em vídeo
Apresentação do software CLC Genomics Workbench: interface, ferramentas e fluxos de trabalho
Fundamentos da análise metagenômica: genes marcadores, shotgun e metatranscriptoma
Instalação, configuração inicial e navegação no ambiente do CLC
Importação e pré-processamento de dados NGS
Exercícios iniciais hands-on com análise de dados de exemplo
Módulo 2 – Análises Práticas em Metagenômica com CLC Genomics (Presencial)
Atividades práticas com acompanhamento de especialista da QIAGEN
Análise de genes marcadores (16S rRNA): montagem, filtragem, classificação taxonômica e visualização
Análise de metagenômica shotgun e metatranscriptoma: montagem, anotação funcional e interpretação
Geração de relatórios e exportação de resultados
Sessão de consultoria prática: aplicação do CLC Genomics a dados reais dos participantes
Discussão de estratégias e boas práticas para projetos em metagenômica
Com o avanço das tecnologias de sequenciamento de nova geração (NGS), a análise de dados metagenômicos tornou-se essencial para estudos de microbiomas, saúde humana, ambiental, agrícola e industrial. No entanto, muitos profissionais enfrentam dificuldades na etapa de processamento e interpretação dos dados, seja por falta de ferramentas acessíveis ou por barreiras técnicas. O CLC Genomics oferece uma solução robusta e amigável para análise de metagenômica shotgun, genes marcadores (como 16S rRNA) e metatranscriptoma, sendo amplamente adotado em instituições de pesquisa e diagnóstico.
Este curso supre uma demanda crescente por capacitação prática no uso dessa ferramenta, oferecendo uma oportunidade única de aprendizado com tutoriais guiados, acompanhamento de especialistas e consultoria aplicada à realidade dos participantes. A formação contribui para a autonomia dos profissionais da área de genômica no uso de ferramentas modernas e para a melhoria da qualidade das análises bioinformáticas em projetos científicos e tecnológicos.
Objetivo Geral
Capacitar profissionais, pesquisadores e estudantes da área de genômica para realizar análises de dados metagenômicos (shotgun, metatranscriptoma e genes marcadores como 16S rRNA) utilizando o software CLC Genomics, por meio de atividades práticas guiadas, tutoriais e consultoria especializada, promovendo a autonomia no uso da ferramenta e a aplicação de boas práticas em bioinformática.
Objetivos Educacionais/Aprendizagem
Ao final do curso, os participantes serão capazes de:
- Identificar e selecionar estratégias apropriadas para análises de dados metagenômicos com base nos objetivos do estudo (genes marcadores, shotgun ou metatranscriptoma).
- Navegar com autonomia no ambiente do CLC Genomics Workbench, explorando suas principais funcionalidades aplicadas à metagenômica.
- Executar pipelines completos de análise de dados de metagenômica por genes marcadores (como 16S rRNA) e shotgun/metatranscriptoma, incluindo importação, filtragem, montagem, classificação taxonômica e análise funcional.
- Interpretar criticamente os resultados obtidos, reconhecendo limitações técnicas e metodológicas.
- Aplicar boas práticas em bioinformática para organização, análise e documentação de projetos metagenômicos.
- Buscar soluções para problemas práticos em análise de dados metagenômicos com o suporte de especialistas e da documentação do software.
Metodologia
O curso será ofertado em formato híbrido, com um dia de atividades remotas e um dia presencial. A abordagem metodológica combina exposições guiadas, tutoriais em vídeo, práticas supervisionadas e consultoria especializada, proporcionando uma experiência de aprendizagem ativa, aplicada e interativa.
No primeiro dia (remoto), os participantes terão acesso a tutoriais em vídeo e materiais introdutórios sobre o CLC Genomics Workbench, com atividades hands-on autoinstrutivas para familiarização com a interface e os fluxos de trabalho básicos.
No segundo dia (presencial), as atividades serão focadas em exercícios práticos com acompanhamento de especialista da QIAGEN, incluindo:
Análise de dados de genes marcadores (16S rRNA);
Análise de dados de metagenômica shotgun e metatranscriptoma;
Sessão de consultoria para discussão de problemas reais trazidos pelos participantes e orientação para aplicação do CLC em seus projetos.
A metodologia privilegia a aprendizagem baseada em problemas e na prática, com ênfase na autonomia do participante e no desenvolvimento de competências aplicáveis ao seu contexto de pesquisa ou trabalho.
Avaliação
A avaliação dos participantes será baseada na presença nas atividades (remota e presencial) e na interação durante as aulas e atividades práticas. Para a obtenção do certificado, será exigida a participação ativa nas sessões.
Pré-requisito
Cada participante deverá trazer seu próprio computador/laptop com as seguintes configurações mínimas recomendadas para uso do software CLC Genomics:
Sistema operacional (64 bits):
- Windows: Windows 10, Windows 11, Windows Server 2016, 2019 ou 2022
- Mac: macOS 13, 14 ou 15
- Linux: RHEL 8+, SUSE Linux Enterprise Server 12.5+ (outros sistemas Linux recentes podem funcionar, mas não são garantidos).
- Para uso de funcionalidades BLAST, é necessário ter a biblioteca libnsl.so.1
Memória RAM:
- Mínimo: 8 GB
- Recomendado: 16 GB
Tela:
- Resolução mínima: 1024 x 768
- Recomendado: 1600 x 1200
Estrutura
Módulo 1 – Introdução ao CLC Genomics (Remoto)
Atividades autoinstrutivas com tutoriais em vídeo
Apresentação do software CLC Genomics Workbench: interface, ferramentas e fluxos de trabalho
Fundamentos da análise metagenômica: genes marcadores, shotgun e metatranscriptoma
Instalação, configuração inicial e navegação no ambiente do CLC
Importação e pré-processamento de dados NGS
Exercícios iniciais hands-on com análise de dados de exemplo
Módulo 2 – Análises Práticas em Metagenômica com CLC Genomics (Presencial)
Atividades práticas com acompanhamento de especialista da QIAGEN
Análise de genes marcadores (16S rRNA): montagem, filtragem, classificação taxonômica e visualização
Análise de metagenômica shotgun e metatranscriptoma: montagem, anotação funcional e interpretação
Geração de relatórios e exportação de resultados
Sessão de consultoria prática: aplicação do CLC Genomics a dados reais dos participantes
Discussão de estratégias e boas práticas para projetos em metagenômica