Apresentação
Este curso oferece uma formação prática e aplicada no uso do CLC Genomics, software da QIAGEN voltado para análise e visualização de dados de sequenciamento de nova geração (NGS). Com foco em análises de Metagenômica Shotgun, Metatranscriptoma e Genes Marcadores (como 16S rRNA), o curso é dividido em dois dias: o primeiro com atividades remotas e o segundo com encontro presencial.
O cronograma inclui:
Modalidade: Semipresencial
Carga Horária: 12 horas
Detalhamento da carga horária
Público Alvo:
Pesquisadores, profissionais, técnicos e estudantes que atuam nas áreas de genômica, metagenômica, microbiologia, bioinformática ou ciências ômicas, com interesse em análise de dados de sequenciamento de nova geração (NGS), especialmente voltados para estudos de microbiomas, genes marcadores (como 16S rRNA), metagenômica shotgun e metatranscriptoma.
Processo Seletivo:
As inscrições serão avaliadas pela Coordenação do Curso com base no interesse dos participantes e critérios do público-alvo levando em conta as respostas ao formulário de inscrição que deverão ser obrigatoriamente preenchidas:
Cada participante deverá trazer seu próprio computador/laptop com as seguintes configurações mínimas recomendadas para uso do software CLC Genomics:
Sistema operacional (64 bits):
Local de Realização do Curso
Sala 1-101 do Pavilhão Luiz Fernando Ferreira (CPIV) - Fiocruz Campus Maré
Ambiente Virtual de Aprendizagem (AVA) - Campus Virtual Fiocruz
O cronograma inclui:
- Atividades hands-on guiadas por tutoriais em vídeo;
- Sessão prática com especialista da QIAGEN para uso do CLC Genomics;
- Consultoria individual para resolução de problemas reais dos participantes;
- Análise prática de dados metagenômicos com genes marcadores (16S);
- Análise prática de dados metagenômicos Shotgun e de metatranscriptoma.
- Indicado para pesquisadores, pós-docs e estudantes, o treinamento combina teoria e prática para capacitar os participantes na condução de projetos metagenômicos com o suporte de uma ferramenta robusta e intuitiva.
Modalidade: Semipresencial
Carga Horária: 12 horas
Detalhamento da carga horária
- Dia 1 (remoto): 09h00 às 16h30
- Dia 2 (presencial): 09h00 às 16h30
Público Alvo:
Pesquisadores, profissionais, técnicos e estudantes que atuam nas áreas de genômica, metagenômica, microbiologia, bioinformática ou ciências ômicas, com interesse em análise de dados de sequenciamento de nova geração (NGS), especialmente voltados para estudos de microbiomas, genes marcadores (como 16S rRNA), metagenômica shotgun e metatranscriptoma.
Processo Seletivo:
As inscrições serão avaliadas pela Coordenação do Curso com base no interesse dos participantes e critérios do público-alvo levando em conta as respostas ao formulário de inscrição que deverão ser obrigatoriamente preenchidas:
- Uso anterior do programa CLC Genomics (sim ou não).
- Qual instituto e laboratório está vinculado.
- Qual o vínculo institucional (Servidor, Terceirizado, Pós-doc, Mestrando, Doutorando, Outro - Especificar).
- Justificativa do interesse em realizar este treinamento.
Cada participante deverá trazer seu próprio computador/laptop com as seguintes configurações mínimas recomendadas para uso do software CLC Genomics:
Sistema operacional (64 bits):
- Windows: Windows 10, Windows 11, Windows Server 2016, 2019 ou 2022
- Mac: macOS 13, 14 ou 15
- Linux: RHEL 8+, SUSE Linux Enterprise Server 12.5+ (outros sistemas Linux recentes podem funcionar, mas não são garantidos).
- Para uso de funcionalidades BLAST, é necessário ter a biblioteca libnsl.so.1
- Mínimo: 8 GB
- Recomendado: 16 GB
- Resolução mínima: 1024 x 768
- Recomendado: 1600 x 1200
Local de Realização do Curso
Sala 1-101 do Pavilhão Luiz Fernando Ferreira (CPIV) - Fiocruz Campus Maré
Ambiente Virtual de Aprendizagem (AVA) - Campus Virtual Fiocruz