O curso será estruturado em cinco módulos. Sendo eles: 

Módulo I: Identidade E Territórios Dos Povos Das Águas
Módulo II: Determinação Social Da Saúde Dos(As) Pescadores(As) Artesanais E Saúde Dos(As) Pescadores(As) Artesanais. 
Módulo III: Papel da Atenção Primária à Saúde (APS)
Módulo IV: Saúde E Ambiente: Desastres Socioambientais, Mudanças Climáticas E Saúde Da População Das Águas
Módulo V: Vigilância Em Saúde Do Trabalhador E Da Trabalhadora Da Pesca Artesanal